药品专利期限补偿（PTE）的直接上位法依据为《专利法》第四十二条第三款，实施层面的细化规定见于《专利法实施细则》第八十条至第八十四条及《专利审查指南》第五部分第九章。一般规则为：为弥补新药上市审评审批所耗时间，对在中国获准上市的创新药及特定改良型新药的相关发明专利，专利权人可自该药品获上市许可之日起三个月内请求补偿；补偿期限不得超过五年，且新药批准上市后该专利的总有效专利权期限不得超过十四年。

此层判定“能否进入PTE程序”，任一条件不满足则直接终止。

条件1（药品品类）：

• if 该药品为化学药1类、预防用/治疗用生物制品1类，或中药1类（即创新药）→ 准予进入品类筛选；
• elif 该药品属于以下特定改良型新药：化学药2.1类（成盐成酯）、2.4类（新适应症）；预防用生物制品2.2类（菌毒种改进）；治疗用生物制品2.2类（新增适应症）；中药2.3类（增加功能主治）→ 准予进入品类筛选；
• else → 直接驳回，不符合申请主体资格。

条件2（专利类型）：在上述药品品类通过的前提下，

• if 请求补偿的专利权利要求保护的是该药品的活性物质产品、制备方法或医药用途之一 → 进入下一层筛选；
• else（如属于制剂、晶型、检测方法等）→ 直接驳回，专利类型不符。

条件3（期限） 专利权人必须自新药在中国获得上市许可之日起三个月内提出纸件请求；超期则视为放弃，国家知识产权局不予受理。

在满足第一层的基础上，本层判定多项并列前提（逻辑上为`AND`关系，但其中包含互斥性的`if-else`子分支）：

硬性时间前提（无例外）：

• 该专利的授权公告日 必须早于 药品上市许可批准日；若授权日晚于批准日，则永久丧失申请资格。
• 提出请求时，专利权必须处于有效状态（未到期、未被宣告无效）。
• 请求补偿时，该专利的剩余保护期不得少于6个月；若少于6个月，则不予补偿。

互斥性选择前提（核心的交叉约束，即“一药一专利”与“一专利一药”）：

• 针对同一药品：若该药品同时存在多项符合前述条件的专利（如化合物专利、方法专利同时存在），则专利权人只能择其一（`if 专利A then 排除专利B and 专利C`）；
• 针对同一专利：若该专利同时覆盖了多个已获批上市的不同药品，则专利权人只能择其一（`if 药品甲 then 排除药品乙 and 药品丙`）；
• 注意：此处的“择一”若处理不当（如对同一药品的两项专利分别提交两份请求），国家知识产权局将对后提交的请求作出不予补偿决定。

设定变量如下：

• 设 D = 药品首次获得上市许可之日；
• 设 F = 该专利的申请日；
• 设 PTA = 该专利已获得的“因审查延迟的专利权期限补偿”（即普通补偿）；

第一步：计算理论补偿值

理论补偿值 T = D − F − 5年

第二步：引入PTA修正后的总期限推演 此处必须考虑PTA是否已经介入。法律规定的最终红线是“批准上市后总有效期≤14年”，而非简单的“补偿期限≤5年”。具体推演如下：

IF 该专利已被授予了PTA（即存在因审查延迟的补偿） THEN
    // 注意：PTA补偿的是授权过程中的时间损耗，PTE补偿的是上市审批的时间损耗，两者需叠加计算总出口。
    基准剩余期限 = 20年 + PTA的实际天数 - (D - F)；
    // 此处 (D - F) 代表从申请到上市的总跨度。
ELSE
    基准剩余期限 = 20年 - (D - F)；
END IF

// 计算法定的“可补偿上限”
可补偿的上限封顶值 C = 14年 - 基准剩余期限；

// 最终实际核准的补偿期限（P）
实际补偿期限 P = MIN（理论补偿值 T , 5年 , 可补偿的上限封顶值 C）；

IF P ≤ 0 THEN
    决定：不予补偿；
ELSE
    决定：最终补偿期限 = P；
END IF

最终补偿值 = min[ (D − F − 5年) , 5年 , (14年 − (20年 + PTA天数 − (D − F)) ) ]

若无PTA，则PTA天数按0代入。